13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28850  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  780    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0643  hypothetical protein  39.5 
 
 		 550 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.24252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07200  hypothetical protein  32.93 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4428  hypothetical protein  31.18 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4444  hypothetical protein  31.84 
 
 		 363 aa  173  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31820  hypothetical protein  34.28 
 
 		 344 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1118  hypothetical protein  36.9 
 
 		 354 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301061  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04420  hypothetical protein  34.06 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3460  hypothetical protein  31.22 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2199  hypothetical protein  27.67 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4332  hypothetical protein  41.67 
 
 		 165 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1302  hypothetical protein  30.19 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2887  hypothetical protein  25.29 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.286834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>