16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26660 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  586  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  63.51 
 
 
287 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1065  hypothetical protein  61.57 
 
 
289 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390948  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  64.86 
 
 
280 aa  352  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2065  hypothetical protein  63.77 
 
 
280 aa  348  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.379601  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  59.72 
 
 
343 aa  341  8e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2883  hypothetical protein  49.11 
 
 
310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  47.52 
 
 
298 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  47.48 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  33.71 
 
 
259 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  32.59 
 
 
259 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  33.09 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43168  predicted protein  28.32 
 
 
282 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  28.76 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0689  hypothetical protein  30.23 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1260  hypothetical protein  26.76 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>