50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24230  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.60384  normal  0.0961367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1519  hypothetical protein  65.24 
 
 		 272 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2255  hypothetical protein  52.09 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2471  hypothetical protein  48.34 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2195  hypothetical protein  50 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2241  hypothetical protein  50 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0569668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2184  hypothetical protein  50 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  hitchhiker  0.00922268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3929  hypothetical protein  52.91 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056579  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3758  hypothetical protein  52.6 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000411746  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12708  hypothetical protein  47.14 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0664757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2125  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  42.86 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1887  integral membrane alanine and leucine rich protein  40.72 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4236  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  40.99 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113628  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1080  hypothetical protein  36.96 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.990505  normal  0.0894269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4529  hypothetical protein  40.1 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3309  hypothetical protein  36.91 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0382594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5193  hypothetical protein  47.21 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1449  hypothetical protein  39.63 
 
 		 223 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.301993  hitchhiker  0.00206659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1484  hypothetical protein  39.17 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5606  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  41.84 
 
 		 206 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal  0.259216 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5314  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  41.84 
 
 		 206 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5226  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  41.84 
 
 		 206 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1639  hypothetical protein  36.56 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  0.220576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1321  hypothetical protein  43.3 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1632  hypothetical protein  38.1 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000168856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1639  hypothetical protein  36.84 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1875  hypothetical protein  32.65 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1407  hypothetical protein  35.35 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0260  hypothetical protein  29.15 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2287  hypothetical protein  31.98 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0492  hypothetical protein  27.31 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.165754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1709  hypothetical protein  30.47 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0885217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2876  hypothetical protein  29.72 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0620073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6761  hypothetical protein  29.61 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1932  hypothetical protein  35.37 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.748587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14520  hypothetical protein  27.68 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1706  hypothetical protein  34.98 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0678311  normal  0.108804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1560  hypothetical protein  34.48 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0388  hypothetical protein  30.54 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2576  hypothetical protein  32.37 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2956  hypothetical protein  29.65 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13090  hypothetical protein  34.27 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3908  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16150  hypothetical protein  43.94 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.596179  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15770  hypothetical protein  33.88 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0917731  normal  0.361516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3179  hypothetical protein  29.08 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2905  hypothetical protein  30.18 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34720  hypothetical protein  29.59 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3294  hypothetical protein  30.22 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.900451  normal  0.652925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>