16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07750 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07750  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  270  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2270  hypothetical protein  60.63 
 
 
133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000078437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  58.65 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  44.8 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3823  Protein of unknown function DUF2267  39.84 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3772  Protein of unknown function DUF2267  36.99 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0721  hypothetical protein  41.54 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0171189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  38.28 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4770  hypothetical protein  37.74 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9020  hypothetical protein  37.98 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4495  hypothetical protein  38.32 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3998  hypothetical protein  38.1 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3361  hypothetical protein  35.77 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3703  Protein of unknown function DUF2267  47.46 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7349  hypothetical protein  32.81 
 
 
259 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>