70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0609 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  50.93 
 
 		 163 aa  173  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  38.81 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  41.79 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  35.44 
 
 		 188 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  34.36 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  35.34 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  33.74 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  36.57 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  29.59 
 
 		 208 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  29.27 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  31.41 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  29.82 
 
 		 176 aa  94.4  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  36.09 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  30.57 
 
 		 210 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  34.38 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  31.95 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  40.98 
 
 		 196 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  28.66 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  29.76 
 
 		 212 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  28.66 
 
 		 169 aa  91.3  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  33.93 
 
 		 174 aa  90.9  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  32.14 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  32.58 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  32.58 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  32.58 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  32.58 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  27.56 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  32.48 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  29.65 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  30.6 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  32.33 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  29.34 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  34.59 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  31.06 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  31.06 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  31.2 
 
 		 185 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  31.06 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  28.74 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  30.83 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  30.08 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  32.95 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  31.54 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  38.27 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  29.29 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  25.29 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  28.67 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  32.12 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  36.46 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  27.27 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  26.19 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  27.4 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  25.17 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  25.15 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  28.7 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  34.78 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  24.24 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  21.37 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  24.85 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  35.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  29.13 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  23.4 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  24.32 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1826  hypothetical protein  30.2 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  24.62 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  24.65 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  24.58 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  28.38 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>