9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4360 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4360  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  723    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5111  lipoprotein  48.58 
 
 		 350 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.472196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2391  lipoprotein  46.46 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal  0.755106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5318  hypothetical protein  41.3 
 
 		 329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224058  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03172  putative signal peptide protein  32.55 
 
 		 346 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.203589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2685  hypothetical protein  25.12 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282963  normal  0.122648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4172  hypothetical protein  34.02 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  26.91 
 
 		 582 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6719  hypothetical protein  23.41 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.759063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>