11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4046 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4046  hypothetical protein  100 
 
 		 799 aa  1566    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.850338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4439  hypothetical protein  72.39 
 
 		 827 aa  1060    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041911  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1266  hypothetical protein  41.4 
 
 		 990 aa  250  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1072  hypothetical protein  39.47 
 
 		 704 aa  222  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9101  hypothetical protein  34.45 
 
 		 309 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04050  hypothetical protein  37.75 
 
 		 309 aa  101  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0246073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0470  hypothetical protein  30.04 
 
 		 426 aa  97.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1596  hypothetical protein  32.89 
 
 		 771 aa  84  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0249858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2220  hypothetical protein  33.54 
 
 		 152 aa  77  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122347  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1597  hypothetical protein  36.97 
 
 		 763 aa  68.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3430  hypothetical protein  49.23 
 
 		 284 aa  63.9  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>