12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3687 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3687  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  501  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17813  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4067  hypothetical protein  81.55 
 
 
233 aa  329  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0845008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1381  hypothetical protein  42.39 
 
 
238 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.294296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1433  hypothetical protein  43.68 
 
 
259 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208283  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8785  hypothetical protein  39.68 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0776  hypothetical protein  38.34 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2014  hypothetical protein  39.42 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00715449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0117  hypothetical protein  39.08 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2613  hypothetical protein  37.75 
 
 
241 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0089414  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1259  hypothetical protein  36.86 
 
 
253 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.114154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4496  hypothetical protein  40.51 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0272  hypothetical protein  32.27 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>