20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3054 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3280  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  84.56 
 
 		 840 aa  1346    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176441  normal  0.54518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3054  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  100 
 
 		 831 aa  1630    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178849  normal  0.019109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3271  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.83 
 
 		 811 aa  147  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3045  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  30.84 
 
 		 811 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.258085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3046  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.45 
 
 		 761 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3272  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.82 
 
 		 761 aa  108  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4346  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.69 
 
 		 769 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851094  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3580  Lantibiotic dehydratase domain protein  40.16 
 
 		 773 aa  68.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0356  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  30.77 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228849  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2427  hypothetical protein  27.88 
 
 		 758 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227999  normal  0.0119009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0360  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  36.8 
 
 		 736 aa  60.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74904  normal  0.237958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3584  Lantibiotic dehydratase domain protein  40.94 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2426  hypothetical protein  26.65 
 
 		 761 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0137052  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2425  hypothetical protein  34.19 
 
 		 767 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00583554  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0922  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.37 
 
 		 895 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3048  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.28 
 
 		 749 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.202481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3692  Lantibiotic dehydratase domain protein  34.53 
 
 		 904 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4059  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.41 
 
 		 845 aa  48.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.690288  normal  0.527374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3274  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.41 
 
 		 749 aa  47.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2433  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  32.58 
 
 		 916 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.618289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>