20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3048 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3048  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  100 
 
 
749 aa  1497    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.202481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3274  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  87.52 
 
 
749 aa  1283    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3271  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.39 
 
 
811 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628325  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3045  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.88 
 
 
811 aa  141  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3272  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.3 
 
 
761 aa  124  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42354  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3046  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.56 
 
 
761 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3580  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.21 
 
 
773 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4346  Lantibiotic dehydratase domain protein  28.85 
 
 
769 aa  94.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851094  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0360  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.15 
 
 
736 aa  92  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74904  normal  0.237958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2426  hypothetical protein  26.72 
 
 
761 aa  90.5  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0137052  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0356  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  24.4 
 
 
778 aa  90.1  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228849  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2427  hypothetical protein  31.02 
 
 
758 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227999  normal  0.0119009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3054  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.15 
 
 
831 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178849  normal  0.019109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3584  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.15 
 
 
761 aa  77.4  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3280  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.13 
 
 
840 aa  72  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176441  normal  0.54518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3429  Lantibiotic dehydratase domain protein  27.35 
 
 
782 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2425  hypothetical protein  28.37 
 
 
767 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00583554  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4059  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.17 
 
 
845 aa  69.3  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.690288  normal  0.527374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4205  Lantibiotic dehydratase domain protein  28.1 
 
 
937 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.254357  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  29.75 
 
 
1035 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>