21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3046 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3046  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  100 
 
 
761 aa  1498    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3272  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  88.44 
 
 
761 aa  1293    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42354  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3271  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.12 
 
 
811 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628325  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3045  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.64 
 
 
811 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3054  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.76 
 
 
831 aa  114  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178849  normal  0.019109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3280  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.3 
 
 
840 aa  108  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176441  normal  0.54518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3048  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.06 
 
 
749 aa  101  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.202481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3274  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.7 
 
 
749 aa  99  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4346  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.6 
 
 
769 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851094  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3692  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.37 
 
 
904 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3580  Lantibiotic dehydratase domain protein  30.38 
 
 
773 aa  61.6  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0360  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.19 
 
 
736 aa  61.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74904  normal  0.237958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3429  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.57 
 
 
782 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0356  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  30.31 
 
 
778 aa  54.7  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228849  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3584  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.06 
 
 
761 aa  54.3  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2425  hypothetical protein  35.83 
 
 
767 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00583554  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2427  hypothetical protein  35.29 
 
 
758 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227999  normal  0.0119009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4059  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.71 
 
 
845 aa  48.5  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.690288  normal  0.527374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2433  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.15 
 
 
916 aa  45.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0550  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  30.61 
 
 
858 aa  45.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13765  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2588  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.15 
 
 
919 aa  44.3  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233589  normal  0.182306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>