23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2433 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2433  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  100 
 
 
916 aa  1822    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4205  Lantibiotic dehydratase domain protein  44.68 
 
 
937 aa  686    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.254357  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3692  Lantibiotic dehydratase domain protein  47.77 
 
 
904 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2588  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  87.96 
 
 
919 aa  1529    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233589  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0922  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  26.11 
 
 
895 aa  181  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1490  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.3 
 
 
897 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0550  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.47 
 
 
858 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13765  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3861  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.86 
 
 
817 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5328  Lantibiotic dehydratase domain protein  27.16 
 
 
851 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4231  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.58 
 
 
962 aa  84.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4196  hypothetical protein  26.79 
 
 
853 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.34 
 
 
1055 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.66 
 
 
757 aa  58.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.15 
 
 
1060 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  33.7 
 
 
1148 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0356  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  31.29 
 
 
778 aa  50.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228849  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3045  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  34.26 
 
 
811 aa  50.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3272  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  30.43 
 
 
761 aa  49.3  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42354  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3271  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  31.13 
 
 
811 aa  48.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3580  Lantibiotic dehydratase domain protein  30.88 
 
 
773 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4346  Lantibiotic dehydratase domain protein  30 
 
 
769 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851094  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3054  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  32.58 
 
 
831 aa  46.2  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178849  normal  0.019109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3046  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.15 
 
 
761 aa  45.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.159475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>