15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2065 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2065  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  573  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.379601  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  87.86 
 
 
280 aa  507  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1065  hypothetical protein  64.26 
 
 
289 aa  368  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390948  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  63.9 
 
 
287 aa  367  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  63.08 
 
 
343 aa  348  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  63.77 
 
 
289 aa  348  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2883  hypothetical protein  48.92 
 
 
310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  47.76 
 
 
298 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  43.53 
 
 
293 aa  241  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  33.46 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  36.4 
 
 
259 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  35.88 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43168  predicted protein  27.59 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  25.14 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1260  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>