73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1534 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1534  chlorite dismutase  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962183  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1476  chlorite dismutase  94.85 
 
 
233 aa  454  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166814  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3926  Chlorite dismutase  71.49 
 
 
241 aa  362  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1891  Chlorite dismutase  70.59 
 
 
238 aa  353  8.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.297673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1766  Chlorite dismutase  68.7 
 
 
238 aa  341  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000058609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3671  chlorite dismutase  67.95 
 
 
240 aa  324  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.161413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2261  chlorite dismutase  66.22 
 
 
237 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.267683  normal  0.0759914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6785  Chlorite dismutase  64.78 
 
 
252 aa  315  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.777367  normal  0.25282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24070  hypothetical protein  67.69 
 
 
230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84912  normal  0.0210051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6718  hypothetical protein  61.64 
 
 
235 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2827  Chlorite dismutase  61.44 
 
 
236 aa  301  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1336  chlorite dismutase  62.23 
 
 
231 aa  299  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0486629  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2265  Chlorite dismutase  63.52 
 
 
234 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.557365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1554  Chlorite dismutase  63.72 
 
 
232 aa  297  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1587  Chlorite dismutase  62.5 
 
 
243 aa  291  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06265  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3917  chlorite dismutase  62.28 
 
 
233 aa  290  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.657436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12691  hypothetical protein  62.67 
 
 
231 aa  289  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.90726e-33  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2483  chlorite dismutase  63.16 
 
 
234 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.359511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5173  chlorite dismutase  59.74 
 
 
254 aa  289  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000990081  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15650  hypothetical protein  56.9 
 
 
241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.228607  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2203  chlorite dismutase  60.7 
 
 
234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451724  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2260  chlorite dismutase  60.7 
 
 
234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2214  chlorite dismutase  60.7 
 
 
234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2406  Chlorite dismutase  60.61 
 
 
238 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  hitchhiker  0.00264181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1896  hypothetical protein  57.94 
 
 
233 aa  277  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249217  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08350  hypothetical protein  58.26 
 
 
250 aa  271  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1894  Chlorite dismutase  59.83 
 
 
236 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1546  Chlorite dismutase  57.47 
 
 
239 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.18455  normal  0.203099 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1885  Chlorite dismutase  55.02 
 
 
241 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1089  Chlorite dismutase  58.06 
 
 
247 aa  261  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2623  Chlorite dismutase  57.27 
 
 
255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1380  chlorite dismutase  57.45 
 
 
230 aa  257  9e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.138403  normal  0.465686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0151  Chlorite dismutase  60.56 
 
 
222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2769  chlorite dismutase  50.95 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0051176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2491  Chlorite dismutase  50 
 
 
233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26770  hypothetical protein  45.91 
 
 
250 aa  198  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.379251  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15210  hypothetical protein  49.73 
 
 
238 aa  185  7e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0747  chlorite dismutase  34.38 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0515  chlorite dismutase  32.57 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3545  chlorite dismutase  29.17 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.84719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2990  Chlorite dismutase  30.65 
 
 
263 aa  89.4  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1747  chlorite dismutase  28.49 
 
 
233 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127686  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1404  Chlorite dismutase  29.03 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288752 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1710  chlorite dismutase  23.89 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.326079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2898  Chlorite dismutase  31.55 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2027  chlorite dismutase  27.27 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0723  chlorite dismutase  31.09 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.996337  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3909  putative heme peroxidase  25.37 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5440  putative heme peroxidase  25.89 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5511  putative heme peroxidase  25.89 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5517  putative heme peroxidase  25.38 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5483  putative heme peroxidase  25.38 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5239  putative heme peroxidase  25.38 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5069  putative heme peroxidase  25.38 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5086  putative heme peroxidase  25.38 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5637  putative heme peroxidase  25.38 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5567  putative heme peroxidase  25.38 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5181  putative heme peroxidase  25.38 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0235  putative heme peroxidase  23 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0625  putative heme peroxidase  22.82 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0610  putative heme peroxidase  22.82 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3473  putative heme peroxidase  23.45 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2033  Chlorite dismutase  33.33 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145624  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2193  Chlorite dismutase  30.1 
 
 
520 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.242985  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1250  hypothetical protein  27.87 
 
 
685 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249744  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1765  Chlorite dismutase  25 
 
 
250 aa  52  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3365  putative heme peroxidase  22.83 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0342697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1222  hypothetical protein  30.1 
 
 
699 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1506  Chlorite dismutase  29.13 
 
 
517 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1843  Chlorite dismutase  29.69 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2580  chlorite dismutase  23.04 
 
 
282 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0889379  normal  0.359618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3475  Chlorite dismutase  29.13 
 
 
518 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3790  Chlorite dismutase  24.62 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>