13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1226 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1226  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  242  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.202239  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1118  hypothetical protein  86.82 
 
 		 129 aa  209  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4363  hypothetical protein  37.6 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0772825  normal  0.0611564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6022  hypothetical protein  32.43 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4078  hypothetical protein  33.93 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1905  low molecular weight protein antigen 6 (CFP-6)  29.77 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1951  low molecular weight protein antigen 6 (CFP-6)  29.77 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13019  low molecular weight protein antigen 6 cfp6  38.67 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222922  normal  0.150713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08860  hypothetical protein  37.96 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1885  low molecular weight protein antigen 6 (CFP-6)  30.4 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0410593  normal  0.277922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4240  hypothetical protein  35.87 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2865  hypothetical protein  34.18 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3231  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>