14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0689 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0689  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4656  hypothetical protein  48.09 
 
 
247 aa  234  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1260  hypothetical protein  38.08 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0908  hypothetical protein  35.51 
 
 
249 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.86539 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  35.89 
 
 
254 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  28.29 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  29.46 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  28.36 
 
 
293 aa  50.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  27.59 
 
 
343 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  30.23 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  29 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  27.91 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  26.71 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  25.98 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>