218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1977 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  74.46 
 
 		 238 aa  377  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  69.6 
 
 		 227 aa  339  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  63.32 
 
 		 228 aa  321  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  64.04 
 
 		 232 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  66.67 
 
 		 227 aa  318  7e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  63.16 
 
 		 227 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  63.35 
 
 		 230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  61.5 
 
 		 232 aa  304  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  60.96 
 
 		 228 aa  301  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  60.43 
 
 		 232 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  62.83 
 
 		 230 aa  299  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  60.09 
 
 		 234 aa  292  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  57.46 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  56.77 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  55.22 
 
 		 234 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  49.56 
 
 		 259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  51.1 
 
 		 232 aa  241  5e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  50.66 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  49.78 
 
 		 232 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  49.33 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  49.78 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  49.78 
 
 		 236 aa  231  6e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  48.68 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  43.56 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  39.13 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  38.03 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  38.16 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  37.66 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  37.18 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  36.86 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  36.44 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  30.29 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  33.33 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  28.33 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  28.99 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  28.41 
 
 		 284 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  27.84 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  28.41 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  28.98 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  30.29 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  27.66 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  32.16 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  30.99 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  29.31 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  29.15 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  27.07 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  29.31 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  27.37 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  25.39 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  28.11 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  24.58 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  27.23 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  26.63 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  27.68 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  28.32 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  28.33 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  28.4 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  27.84 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1198  urease accessory protein UreG  28.21 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  0.215478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  29.86 
 
 		 268 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  29.61 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  28.27 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  26.97 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  26.77 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  24.87 
 
 		 286 aa  51.6  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  28.4 
 
 		 281 aa  51.6  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1358  urease accessory protein UreG  27.69 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  30.81 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  27.27 
 
 		 352 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  26.44 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  26.92 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  29.08 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1137  urease accessory protein UreG  27.69 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  28.09 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  30.81 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  30.81 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  26.49 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  25.56 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  25.89 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  27.43 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  25.63 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  27.38 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  28.42 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  24.47 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  30.9 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  25.37 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  25.53 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  27.55 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  29.08 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  28.72 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  26.4 
 
 		 303 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  27.14 
 
 		 296 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2663  urease accessory protein UreG  30 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  24.21 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  28.49 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  30.67 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  25.28 
 
 		 284 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  26.19 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  25.28 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>