17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2520 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2586    98.81 
 
 
1147 bp  1740    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2520    100 
 
 
1222 bp  2422    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2202    99.45 
 
 
916 bp  1776    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0656033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2204    99.56 
 
 
964 bp  1782    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.144178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2480    99.57 
 
 
1226 bp  1796    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168342  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2388    99.24 
 
 
1144 bp  1760    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.905315  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2503    98.85 
 
 
1138 bp  165  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0724    100 
 
 
2092 bp  157  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00877806  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2359    98.73 
 
 
903 bp  149  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2264    98.73 
 
 
1029 bp  149  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2166    98.73 
 
 
4516 bp  149  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2165    98.73 
 
 
5958 bp  149  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2390    97.67 
 
 
1348 bp  147  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2464    97.47 
 
 
4069 bp  141  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0335  hypothetical protein  100 
 
 
132 bp  109  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.813334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2502  Transposase, ISC1217  98.18 
 
 
636 bp  101  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2380  transposase IS4 family protein  95.92 
 
 
870 bp  73.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>