11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2517 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2517    100 
 
 
920 bp  1824    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.245299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0698    97.3 
 
 
1078 bp  327  3e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2340    96.74 
 
 
669 bp  317  2.9999999999999996e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263028  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2643    95.65 
 
 
1285 bp  301  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2501    92.63 
 
 
258 bp  295  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0795  IS1 transposase  89.45 
 
 
966 bp  216  9e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2468    89.19 
 
 
931 bp  198  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2260    86.7 
 
 
932 bp  165  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2485    94.29 
 
 
90 bp  107  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.011906  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0469  Transposase and inactivated derivatives IS1 family-like protein  78.72 
 
 
423 bp  91.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1580    88.24 
 
 
1141 bp  89.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>