7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2485 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2485    100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.011906  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0795  IS1 transposase  97.78 
 
 
966 bp  163  9e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2260    97.78 
 
 
932 bp  163  9e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2468    97.78 
 
 
931 bp  163  9e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2517    94.29 
 
 
920 bp  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.245299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1494    85.48 
 
 
2103 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1598  IS1 transposase  83.87 
 
 
951 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>