16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2480 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2202    99.02 
 
 
916 bp  1750    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0656033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2204    99.13 
 
 
964 bp  1756    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.144178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2388    98.81 
 
 
1144 bp  1735    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.905315  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2480    100 
 
 
1226 bp  2430    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168342  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2520    99.57 
 
 
1222 bp  1796    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2586    98.38 
 
 
1147 bp  1715    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2413  hypothetical protein  100 
 
 
144 bp  174  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228657  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1490  hypothetical protein  98.84 
 
 
102 bp  163  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2342  hypothetical protein  100 
 
 
135 bp  159  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.789178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2573  hypothetical protein  100 
 
 
225 bp  157  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.147421  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0956    97.65 
 
 
1290 bp  153  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1584  hypothetical protein  98.75 
 
 
165 bp  151  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0197252  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0533    98.73 
 
 
2426 bp  149  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0874    98.73 
 
 
1248 bp  149  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0110  HEPN domain protein  100 
 
 
507 bp  143  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2218  hypothetical protein  97.47 
 
 
144 bp  141  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0438834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>