12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2390 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2390    100 
 
 		 1348 bp  2672    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2520    97.67 
 
 		 1222 bp  147  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2503    96.59 
 
 		 1138 bp  143  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0724    97.5 
 
 		 2092 bp  135  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00877806  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2165    96.25 
 
 		 5958 bp  127  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2166    96.25 
 
 		 4516 bp  127  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2264    96.25 
 
 		 1029 bp  127  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2359    96.25 
 
 		 903 bp  127  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2464    95 
 
 		 4069 bp  119  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2380  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 870 bp  97.6  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0335  hypothetical protein  96.43 
 
 		 132 bp  87.7  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.813334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2502  Transposase, ISC1217  94.64 
 
 		 636 bp  79.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>