28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2371 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2325    98.86 
 
 
2327 bp  2329    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0486807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2816  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  98.85 
 
 
960 bp  1816    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2680  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.27 
 
 
960 bp  1848    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2664  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  98.85 
 
 
960 bp  1816    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2656  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.17 
 
 
960 bp  1840    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000124145  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2655    98.7 
 
 
2330 bp  2315    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000297792  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2621  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.17 
 
 
960 bp  1840    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.833624  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2595  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.17 
 
 
960 bp  1840    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2559    98.87 
 
 
444 bp  839    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2434  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.17 
 
 
960 bp  1840    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.164019  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2418  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  98.85 
 
 
960 bp  1816    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0109903  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2372  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  100 
 
 
960 bp  1903    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2371    100 
 
 
1880 bp  3727    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2326  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.17 
 
 
960 bp  1840    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0106845  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0301  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.17 
 
 
960 bp  1840    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2290  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.27 
 
 
960 bp  1848    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2195  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  98.85 
 
 
960 bp  1816    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0217061  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1504  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.02 
 
 
939 bp  1742    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1446  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  98.85 
 
 
960 bp  1816    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0802897  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1025    98.8 
 
 
1145 bp  1263    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0799  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  98.85 
 
 
960 bp  1816    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0724    98.8 
 
 
2092 bp  1096    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00877806  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0684  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.17 
 
 
960 bp  1840    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000147305  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0683    98.7 
 
 
2327 bp  2313    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000431715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0376  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.17 
 
 
960 bp  1840    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0848995  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0374    98.79 
 
 
3551 bp  2335    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0480919  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0373    98.79 
 
 
4490 bp  2335    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221643  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0357  Transposase, ISC1234/ST1916, Sulfolobus  99.17 
 
 
960 bp  1840    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>