12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2340 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  99.11 
 
 
984 bp  646    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0724    99.11 
 
 
2092 bp  646    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00877806  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  99.11 
 
 
985 bp  646    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1844    99.11 
 
 
985 bp  646    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2168    99.11 
 
 
989 bp  646    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  99.11 
 
 
984 bp  646    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2340    100 
 
 
669 bp  1326    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263028  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2356    97.63 
 
 
979 bp  607  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0698    99.46 
 
 
1078 bp  359  6.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2643    97.83 
 
 
1285 bp  333  4e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2517    96.74 
 
 
920 bp  317  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.245299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1580    94.34 
 
 
1141 bp  81.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>