9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2260 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0795  IS1 transposase  93.17 
 
 
966 bp  1400    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2260    100 
 
 
932 bp  1848    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2468    95.84 
 
 
931 bp  1556    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0469  Transposase and inactivated derivatives IS1 family-like protein  90.88 
 
 
423 bp  361  1.9999999999999998e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2517    86.7 
 
 
920 bp  165  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.245299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2485    97.78 
 
 
90 bp  163  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.011906  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2501    88.73 
 
 
258 bp  69.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1494    87.1 
 
 
2103 bp  60  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1598  IS1 transposase  85.48 
 
 
951 bp  52  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>