12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1496 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0534    95.12 
 
 
1069 bp  981    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1496    100 
 
 
2432 bp  4821    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2045    95.91 
 
 
973 bp  753    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0267006  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2207    97.08 
 
 
2424 bp  2395    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.975531  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2259    95.65 
 
 
1069 bp  979    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2381    96.23 
 
 
985 bp  892    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2486  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  95.48 
 
 
1068 bp  967    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0095339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2503    94.82 
 
 
1138 bp  940    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2731  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  86.79 
 
 
1074 bp  149  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0404628  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0806  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  81.63 
 
 
1068 bp  103  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.268698  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2749  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.69 
 
 
1074 bp  95.6  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0744    96.97 
 
 
922 bp  58  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>