15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0044 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  100 
 
 
106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0746  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  60 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0240663  normal  0.0930395 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0421  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  40.7 
 
 
101 aa  58.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3013  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  36.14 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3200  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  29.17 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1998  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  36.47 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0296724 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0671  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.89 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0560  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.99 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0728  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  30.11 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.154027  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1510  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.26 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0219546  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  30.95 
 
 
93 aa  42  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0943  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  29.89 
 
 
92 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1485  hypothetical protein  31.25 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000525267  hitchhiker  0.00254885 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0168  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.1 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.736645 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1734  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.1 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>