42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4385 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4385  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  188  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0150663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4776  hypothetical protein  85.11 
 
 		 94 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000854569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0119  hypothetical protein  78.72 
 
 		 94 aa  158  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0845  hypothetical protein  72.62 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2687  signal peptide protein  48.31 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13267  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0705  hypothetical protein  47.25 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0725  hypothetical protein  46.15 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1005  putative signal peptide protein  44.94 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2358  putative signal peptide protein  42.7 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00352  hypothetical protein  44.05 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002085  putative signal peptide protein  44.05 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0812  hypothetical protein  45.57 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114629  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2534  putative signal peptide protein  42.17 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352088 
 
 
-
 
NC_003296  RS02371  signal peptide protein  50.85 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.352612  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4402  signal peptide protein  57.14 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4292  putative signal peptide protein  57.14 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4791  hypothetical protein  36.67 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2960  putative signal peptide protein  55.36 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0709  hypothetical protein  39.29 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0945  putative signal peptide protein  36.78 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.461777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0729  hypothetical protein  39.29 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1614  hypothetical protein  29.76 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3132  hypothetical protein  38.37 
 
 		 83 aa  50.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1619  hypothetical protein  32 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1243  hypothetical protein  41.98 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2033  hypothetical protein  53.19 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.230623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6304  hypothetical protein  49.18 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1558  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0381215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3391  hypothetical protein  40.79 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1030  hypothetical protein  46.27 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.89878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0774  hypothetical protein  51.06 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.754477  normal  0.205049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3065  hypothetical protein  55.32 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.516609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0758  hypothetical protein  41.27 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306085  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1608  integral membrane protein-like  52.17 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3131  hypothetical protein  39.73 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5147  hypothetical protein  35.48 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0993  hypothetical protein  55.32 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2191  hypothetical protein  53.19 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  normal  0.810634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4685  hypothetical protein  39.71 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.238421  normal  0.819427 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2029  hypothetical protein  34.41 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5129  hypothetical protein  34.41 
 
 		 103 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1722  hypothetical protein  44.68 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.685505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>