17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4062 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4062  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1487  hypothetical protein  88.03 
 
 		 117 aa  219  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00715013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1508  hypothetical protein  85.47 
 
 		 117 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2168  hypothetical protein  82.05 
 
 		 117 aa  211  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2081  hypothetical protein  78.63 
 
 		 117 aa  200  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1338  hypothetical protein  75.21 
 
 		 117 aa  194  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0769021  hitchhiker  0.0000834558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0233  hypothetical protein  69.23 
 
 		 117 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0099  hypothetical protein  67.52 
 
 		 135 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16980  hypothetical protein  70 
 
 		 117 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.993879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0243  hypothetical protein  69.09 
 
 		 117 aa  167  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1477  hypothetical protein  68.18 
 
 		 117 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0198  hypothetical protein  65.81 
 
 		 117 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5528  hypothetical protein  64.96 
 
 		 117 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5272  hypothetical protein  66.67 
 
 		 117 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5182  hypothetical protein  65.81 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535352  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5324  hypothetical protein  64.96 
 
 		 117 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3013  hypothetical protein  63.25 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>