57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3838 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3838  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.867887  unclonable  0.00000000015087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0722  phage shock protein A, PspA  96.05 
 
 		 228 aa  440  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000273053  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0888  phage shock protein A, PspA  88.6 
 
 		 229 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0755885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0623  phage shock protein A, PspA  89.04 
 
 		 228 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3450  phage shock protein A, PspA  88.16 
 
 		 229 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0912  phage shock protein A, PspA  88.16 
 
 		 229 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0749469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0922  phage shock protein A, PspA  88.16 
 
 		 229 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3091  phage shock protein A, PspA  87.28 
 
 		 229 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0777554  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0697  PspA/IM30  86.84 
 
 		 229 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000488945  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3482  phage shock protein A, PspA  85.96 
 
 		 229 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0827  phage shock protein A, PspA  86.84 
 
 		 229 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3266  phage shock protein A, PspA  85.96 
 
 		 229 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.942546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3114  phage shock protein A, PspA  86.4 
 
 		 229 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.139469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0858  phage shock protein A, PspA  86.84 
 
 		 229 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3765  hypothetical protein  86.4 
 
 		 229 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2668  PspA/IM30  82.89 
 
 		 229 aa  374  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4191  PspA/IM30 family protein  65.35 
 
 		 229 aa  302  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0185  phage shock protein A, PspA  64.32 
 
 		 227 aa  289  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3389  phage shock protein A, PspA  43.36 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  39.91 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3479  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  40.35 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.111551  normal  0.0139812 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02185  PspA/IM30 family protein  43.11 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  41.99 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  40.69 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5044  phage shock protein A, PspA  39.91 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  40.27 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3703  phage shock protein A, PspA  39.73 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  42.46 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1404  phage shock protein A, PspA  37.28 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.792709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1224  phage shock protein A, PspA  36.12 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01340  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  35.71 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  33.48 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3831  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04011  hypothetical protein  33.48 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4742  PspA/IM30 family protein  33.48 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3811  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04049  predicted transcriptional regulator effector protein  33.48 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4649  PspA/IM30 family protein  33.48 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4653  PspA/IM30 family protein  33.48 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4768  PspA/IM30 family protein  33.48 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5698  PspA/IM30 family protein  33.04 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4789  PspA/IM30 family protein  33.48 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4732  PspA/IM30 family protein  33.48 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  31.86 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5273  phage shock protein A, PspA  30.7 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5545  phage shock protein A, PspA  29.91 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0735  phage shock protein A, PspA  31.51 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1637  phage shock protein A, PspA  28.95 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1604  phage shock protein A, PspA  32.41 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1343  phage shock protein A, PspA  30.24 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.950161  normal  0.204694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4580  phage shock protein A, PspA  28.44 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606937  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2993  phage shock protein A, PspA  26.2 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403474  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3183  phage shock protein A, PspA  23.87 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4514  phage shock protein A, PspA  27.88 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0564095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  27.04 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2957  PspA/IM30 family protein  23.7 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>