16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3651 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3651  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3927  hypothetical protein  81.33 
 
 		 77 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3665  hypothetical protein  77.63 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3788  hypothetical protein  79.73 
 
 		 76 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3600  hypothetical protein  76.32 
 
 		 76 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0642  hypothetical protein  76.32 
 
 		 76 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3254  hypothetical protein  75 
 
 		 76 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0736  hypothetical protein  75.34 
 
 		 76 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0793  hypothetical protein  74.32 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3035  hypothetical protein  74.67 
 
 		 82 aa  114  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3490  hypothetical protein  70.67 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2997  hypothetical protein  63.64 
 
 		 77 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.427885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3231  hypothetical protein  65.22 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3322  hypothetical protein  79.25 
 
 		 59 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2681  hypothetical protein  53.75 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.349139  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0631  hypothetical protein  80 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>