16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3564 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3564  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3155  hypothetical protein  70.91 
 
 		 169 aa  253  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2901  hypothetical protein  68.64 
 
 		 169 aa  249  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0240  hypothetical protein  50.9 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3968  hypothetical protein  45.51 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0239  hypothetical protein  41.92 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0519  hypothetical protein  42.51 
 
 		 164 aa  143  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0312  hypothetical protein  43.11 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0180  hypothetical protein  42.51 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4154  hypothetical protein  42.51 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4286  hypothetical protein  42.51 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0181  hypothetical protein  42.51 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3765  hypothetical protein  42.77 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3838  hypothetical protein  42.17 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3963  hypothetical protein  42.77 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0616  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  94  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>