21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3092 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3092  FlgN family protein  100 
 
 		 141 aa  268  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1592  FlgN family protein  70.92 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.89295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1340  FlgN family protein  62.41 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1335  FlgN family protein  62.41 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3255  flagellar biosynthetic protein FlgN  57.45 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  56.74 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  56.74 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  56.74 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1411  FlgN family protein  56.74 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3105  FlgN family protein  56.03 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2952  FlgN family protein  56.03 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.409825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2967  FlgN family protein  56.03 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2602  FlgN family protein  53.9 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.813191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1156  FlgN family protein  51.8 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  52.48 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2323  flagellar biosynthetic protein FlgN  49.29 
 
 		 144 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.697168  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2343  polar flagellar FlgN, putative chaperone  33.8 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.312185  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1797  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004178  flagellar biosynthesis protein FlgN  31.21 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01279  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone  31.21 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1471  putative flagellar protein FlgN  28.35 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>