51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2924 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  56.05 
 
 		 669 aa  778    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  61.22 
 
 		 668 aa  864    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  50.3 
 
 		 662 aa  684    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  54.95 
 
 		 668 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  49.85 
 
 		 662 aa  680    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  55.69 
 
 		 668 aa  777    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  47.7 
 
 		 667 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  47.85 
 
 		 667 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  100 
 
 		 672 aa  1377    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  51.77 
 
 		 669 aa  729    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  60.77 
 
 		 668 aa  856    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  48.82 
 
 		 674 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  47.1 
 
 		 667 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  39.04 
 
 		 699 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  37.61 
 
 		 703 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  37.7 
 
 		 699 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  38.95 
 
 		 698 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  37.93 
 
 		 695 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  37.93 
 
 		 695 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  37.78 
 
 		 695 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  37.93 
 
 		 695 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  36.75 
 
 		 695 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  36.72 
 
 		 697 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  37.64 
 
 		 695 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  37.64 
 
 		 695 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  37.64 
 
 		 695 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  35.38 
 
 		 693 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  36.38 
 
 		 672 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  36.2 
 
 		 669 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  35.43 
 
 		 704 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  30.68 
 
 		 712 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  30.54 
 
 		 712 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  30.26 
 
 		 712 aa  316  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  30.43 
 
 		 716 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  30.1 
 
 		 716 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  30.29 
 
 		 716 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  31.19 
 
 		 711 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  29.96 
 
 		 716 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  32.09 
 
 		 706 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  29.83 
 
 		 712 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  30.44 
 
 		 703 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  29.56 
 
 		 698 aa  246  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  28.49 
 
 		 656 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  29.16 
 
 		 565 aa  213  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3860  hypothetical protein  29.71 
 
 		 573 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00093801  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  26.32 
 
 		 681 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  24.31 
 
 		 660 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  24.96 
 
 		 706 aa  90.1  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  21.49 
 
 		 772 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  20.29 
 
 		 835 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  21.51 
 
 		 810 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>