82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2828 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  320  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  84.91 
 
 		 168 aa  285  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  84.08 
 
 		 168 aa  276  9e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  77.99 
 
 		 169 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  77.99 
 
 		 169 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  77.99 
 
 		 169 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  77.36 
 
 		 169 aa  261  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  74.21 
 
 		 169 aa  255  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  73.58 
 
 		 169 aa  254  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  77.07 
 
 		 168 aa  254  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  73.58 
 
 		 169 aa  254  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  73.58 
 
 		 169 aa  253  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  73.58 
 
 		 169 aa  253  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  72.96 
 
 		 169 aa  251  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  73.25 
 
 		 169 aa  244  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  68.35 
 
 		 167 aa  233  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  57.32 
 
 		 169 aa  194  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  55.06 
 
 		 169 aa  187  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  55.7 
 
 		 169 aa  187  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  53.8 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  52.87 
 
 		 174 aa  185  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  51.57 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  50 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  46.54 
 
 		 174 aa  164  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  44.94 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  47.17 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  44.03 
 
 		 172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  46.75 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  46.1 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  47.97 
 
 		 210 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  44.67 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  48.1 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  42.14 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  46.31 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  42.68 
 
 		 177 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  41.51 
 
 		 175 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  40.13 
 
 		 179 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  44.65 
 
 		 198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  39.61 
 
 		 185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  41.51 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  43.55 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  36 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  40.49 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  38 
 
 		 196 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  34.86 
 
 		 197 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  34.29 
 
 		 197 aa  97.8  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  31.08 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  32.33 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  31.14 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  31.41 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  41.32 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  33.12 
 
 		 176 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  32.75 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  31.21 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  30.95 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  31.71 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  30.12 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  28.12 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  28.67 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  30.47 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  32.11 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  39.33 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  24.06 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  30.6 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  27.34 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  27.52 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  27.83 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  29.23 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  30.56 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  28.3 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  27.05 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  27.05 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  28.3 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  26.38 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  27.61 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  26.92 
 
 		 178 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  32.95 
 
 		 186 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  38.1 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  22.81 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  26.79 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>