19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2237 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2237  MutT/NUDIX family protein  100 
 
 		 565 aa  1169    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0855857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2502  hypothetical protein  45.42 
 
 		 545 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4226  MutT/nudix family protein  39.06 
 
 		 599 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500357  normal  0.363608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0483  MutT/nudix family protein  39.38 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0516  MutT/NUDIX family protein  39.19 
 
 		 565 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0511  MutT/NUDIX family protein  39.19 
 
 		 565 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2218  hypothetical protein  37.46 
 
 		 555 aa  359  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1775  putative orphan protein  38 
 
 		 555 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0528  MutT/NUDIX family protein  37.11 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1049  hypothetical protein  35.51 
 
 		 562 aa  326  7e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0715894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3447  Zn-dependent hydrolase  32.94 
 
 		 574 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1178  hypothetical protein  34.1 
 
 		 576 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03446  putative orphan protein  33.1 
 
 		 564 aa  302  9e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4243  hypothetical protein  34.05 
 
 		 552 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07015  putative dipeptidyl-peptidase III  27.62 
 
 		 671 aa  84.7  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3045  dipeptidyl-peptidase III  24.72 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_002950  PG0317  M49 family peptidase  26.18 
 
 		 886 aa  61.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.620339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2215  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 177 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0824414  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1280  invasion antigen B  28.45 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>