21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0942 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0942  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0992  hypothetical protein  77.6 
 
 		 196 aa  314  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0857  hypothetical protein  74.73 
 
 		 199 aa  291  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0662  hypothetical protein  65.78 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3821  hypothetical protein  66.3 
 
 		 208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3639  hypothetical protein  66.3 
 
 		 208 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.313555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0748  hypothetical protein  73.89 
 
 		 225 aa  243  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3697  hypothetical protein  65.75 
 
 		 208 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.176724  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0808  hypothetical protein  70.48 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2897  hypothetical protein  63.19 
 
 		 208 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3231  hypothetical protein  72.85 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3351  hypothetical protein  65.17 
 
 		 230 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0602  hypothetical protein  64.04 
 
 		 230 aa  228  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3521  hypothetical protein  61.31 
 
 		 197 aa  228  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0634  hypothetical protein  53.97 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1301  hypothetical protein  49.4 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1568  hypothetical protein  41.26 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00113128  hitchhiker  0.0000220315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2013  hypothetical protein  40.14 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205441  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0724  hypothetical protein  38.1 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000310173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1740  hypothetical protein  32.63 
 
 		 379 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0126  hypothetical protein  32.94 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>