24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9371 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  100 
 
 
713 aa  1399    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  39.57 
 
 
814 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  33.48 
 
 
706 aa  291  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  31.08 
 
 
835 aa  270  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  30.74 
 
 
870 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  31.8 
 
 
820 aa  156  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  28.26 
 
 
884 aa  154  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  29.67 
 
 
784 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  26.67 
 
 
919 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  25.92 
 
 
718 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  26.59 
 
 
728 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  25.68 
 
 
764 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  26.08 
 
 
751 aa  93.2  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  25.97 
 
 
873 aa  90.1  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  25.48 
 
 
706 aa  84.3  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  24.83 
 
 
802 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  28.12 
 
 
717 aa  68.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  26.15 
 
 
831 aa  67.8  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3364  hypothetical protein  25.25 
 
 
711 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  23.99 
 
 
811 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  24.93 
 
 
741 aa  58.2  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  27.93 
 
 
703 aa  52.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  25.07 
 
 
820 aa  52  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4682  hypothetical protein  23.42 
 
 
735 aa  50.8  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>