18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9020 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9020  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  248  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3361  hypothetical protein  59.32 
 
 
121 aa  140  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  42.74 
 
 
196 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  44.35 
 
 
136 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3998  hypothetical protein  40.57 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9245  hypothetical protein  35.83 
 
 
268 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4495  hypothetical protein  36.89 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0721  hypothetical protein  43.33 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0171189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2270  hypothetical protein  36.92 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000078437  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  36.13 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07750  hypothetical protein  37.98 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4770  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3703  Protein of unknown function DUF2267  37.25 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7349  hypothetical protein  31.71 
 
 
259 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  30.71 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3823  Protein of unknown function DUF2267  27.05 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  26.32 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3772  Protein of unknown function DUF2267  29.66 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>