11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7887 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7887  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  253  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8085  hypothetical protein  52.86 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8082  hypothetical protein  42.34 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0741  hypothetical protein  52.08 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000127802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4909  hypothetical protein  28 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8099  hypothetical protein  26.13 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1419  hypothetical protein  41.43 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1872  hypothetical protein  44.26 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  0.488685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  31.46 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 106 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>