19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7754 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7754  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  933    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.904748  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1247  hypothetical protein  39.95 
 
 
560 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.477424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3759  hypothetical protein  33.98 
 
 
461 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2547  hypothetical protein  33.42 
 
 
627 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5988  hypothetical protein  35.76 
 
 
475 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3719  hypothetical protein  33.7 
 
 
483 aa  136  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05140  hypothetical protein  28.05 
 
 
366 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0093  hypothetical protein  25.53 
 
 
361 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1369  hypothetical protein  27.38 
 
 
366 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7173  hypothetical protein  31.48 
 
 
580 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142604  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6603  hypothetical protein  25.97 
 
 
338 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0720  hypothetical protein  26.04 
 
 
370 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1867  hypothetical protein  23.94 
 
 
449 aa  89.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0611  hypothetical protein  25.37 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0811954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1597  hypothetical protein  26.54 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0592  hypothetical protein  24.72 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.60475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4849  hypothetical protein  24.66 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1604  hypothetical protein  26.91 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1632  hypothetical protein  23.4 
 
 
554 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>