22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6511 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6511  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1155    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4772  hypothetical protein  37.8 
 
 
584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.389594  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0947  hypothetical protein  38.04 
 
 
588 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0965  hypothetical protein  38.04 
 
 
588 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0955  hypothetical protein  37.52 
 
 
588 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690545  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1680  hypothetical protein  37.87 
 
 
618 aa  280  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1273  hypothetical protein  35.55 
 
 
591 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722393  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2950  hypothetical protein  29.52 
 
 
596 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3471  hypothetical protein  34.5 
 
 
642 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.515969  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3208  hypothetical protein  28.78 
 
 
624 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.715837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2908  hypothetical protein  30.55 
 
 
617 aa  173  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0456  hypothetical protein  31.77 
 
 
604 aa  169  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5256  hypothetical protein  28.79 
 
 
612 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4224  hypothetical protein  30.19 
 
 
566 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0752  hypothetical protein  29.88 
 
 
647 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0769  hypothetical protein  30.16 
 
 
619 aa  136  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0992  hypothetical protein  26.42 
 
 
585 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3020  hypothetical protein  30.98 
 
 
641 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216512  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0838  hypothetical protein  26.12 
 
 
585 aa  127  8.000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.351988  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1559  hypothetical protein  26.37 
 
 
716 aa  93.6  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1066  hypothetical protein  30.31 
 
 
572 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0195  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 
925 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.39307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>