18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4918 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4918  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1815  VTC domain protein  64.59 
 
 		 319 aa  322  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0240  hypothetical protein  27.95 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.659958  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1555  hypothetical protein  29.52 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0170408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2178  hypothetical protein  29.02 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1407  hypothetical protein  28.25 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03580  VTC domain-containing protein  29.74 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.102393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1141  hypothetical protein  24.23 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0173277  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1595  hypothetical protein  25.45 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00605594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2305  hypothetical protein  25.22 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2978  hypothetical protein  26.41 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0249  hypothetical protein  26.05 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1304  hypothetical protein  23.21 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.795946  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48538  predicted protein  28.76 
 
 		 1027 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13170  VTC domain-containing protein  24.73 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.733284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0701  hypothetical protein  25.56 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2551  hypothetical protein  27.21 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0374  hypothetical protein  30.69 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>