39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3213 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3213  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  754    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446815  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3316  toxic anion resistance family protein  57.85 
 
 
420 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6387  toxic anion resistance family protein  58.68 
 
 
409 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550341  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3025  toxic anion resistance family protein  54.64 
 
 
407 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00868928  hitchhiker  0.000634734 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0261  toxic anion resistance family protein  52.08 
 
 
395 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.343887  normal  0.0699835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37530  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  54.74 
 
 
399 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2919  toxic anion resistance  53.56 
 
 
419 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220942  normal  0.0480971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0765  toxic anion resistance family protein  51.32 
 
 
414 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2419  toxic anion resistance  47.34 
 
 
414 aa  361  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0839824  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2100  hypothetical protein  47.07 
 
 
414 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00242113  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3058  toxic anion resistance family protein  51.84 
 
 
405 aa  358  7e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2138  toxic anion resistance family protein  46.28 
 
 
417 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290254  hitchhiker  0.00275105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2959  toxic anion resistance  50.65 
 
 
415 aa  349  5e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.982902  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2308  toxic anion resistance  48.45 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1633  hypothetical protein  48.27 
 
 
406 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0931  toxic anion resistance  48.45 
 
 
406 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.224852  normal  0.413842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00690  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  40.48 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0312  hypothetical protein  32.45 
 
 
424 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.722745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3493  toxic anion resistance family protein  35.05 
 
 
405 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603001  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4059  toxic anion resistance family protein  39.25 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1518  toxic anion resistance family protein  38.23 
 
 
412 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150292  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2217  hypothetical protein  31.52 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2266  toxic anion resistance family protein  24.32 
 
 
387 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0678634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1786  toxic anion resistance family protein  25.3 
 
 
369 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2916  hypothetical protein  23.77 
 
 
387 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.233445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2414  hypothetical protein  23.77 
 
 
370 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2555  hypothetical protein  23.77 
 
 
370 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2475  hypothetical protein  23.77 
 
 
370 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2491  hypothetical protein  24.78 
 
 
358 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000702786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2458  hypothetical protein  24.78 
 
 
358 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2208  hypothetical protein  24.78 
 
 
358 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0466629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2250  hypothetical protein  24.78 
 
 
358 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00532335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2287  hypothetical protein  24.78 
 
 
358 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0848  toxic anion resistance family protein  19.24 
 
 
439 aa  53.1  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.571741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1941  toxic anion resistance family protein  20.19 
 
 
365 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.0249977 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1660  tellurite resistance protein  22.12 
 
 
379 aa  49.7  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1852  toxic anion resistance  23.23 
 
 
400 aa  47  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.263274  normal  0.0294888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0938  toxic anion resistance family protein  23.59 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308205  normal  0.403453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2264  tellurite resistance protein  23.24 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>