12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2613 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2613  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0089414  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1259  hypothetical protein  68.55 
 
 
253 aa  328  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.114154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1381  hypothetical protein  39.68 
 
 
238 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.294296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0776  hypothetical protein  40.68 
 
 
243 aa  138  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8785  hypothetical protein  37.24 
 
 
244 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.841566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2014  hypothetical protein  37.66 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00715449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1433  hypothetical protein  35.04 
 
 
259 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208283  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3687  hypothetical protein  38.76 
 
 
253 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17813  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4067  hypothetical protein  39.5 
 
 
233 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0845008 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0117  hypothetical protein  36.32 
 
 
232 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4496  hypothetical protein  41.2 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0272  hypothetical protein  32.75 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>