20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2425 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2427  hypothetical protein  86.83 
 
 
758 aa  1233    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227999  normal  0.0119009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2426  hypothetical protein  79.9 
 
 
761 aa  1084    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0137052  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2425  hypothetical protein  100 
 
 
767 aa  1511    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00583554  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3580  Lantibiotic dehydratase domain protein  36.2 
 
 
773 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0356  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.28 
 
 
778 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228849  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0360  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  34.24 
 
 
736 aa  318  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74904  normal  0.237958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3429  Lantibiotic dehydratase domain protein  37.1 
 
 
782 aa  316  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3584  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.61 
 
 
761 aa  283  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4059  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  34.57 
 
 
845 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.690288  normal  0.527374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4346  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.18 
 
 
769 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851094  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  29.33 
 
 
1035 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3045  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.18 
 
 
811 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3271  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.03 
 
 
811 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628325  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3274  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.64 
 
 
749 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3280  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  25.29 
 
 
840 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176441  normal  0.54518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0922  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.03 
 
 
895 aa  65.1  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3048  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.87 
 
 
749 aa  61.2  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.202481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3054  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.04 
 
 
831 aa  53.9  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178849  normal  0.019109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3046  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.83 
 
 
761 aa  51.2  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1490  Lantibiotic dehydratase domain protein  25 
 
 
897 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.190845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>