16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2360 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2360  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.2 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0972  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.37 
 
 		 347 aa  358  8e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00933652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.31 
 
 		 338 aa  357  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.84 
 
 		 343 aa  272  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0526  GTP-binding protein  24.72 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  22.22 
 
 		 606 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>