10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0543 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0543  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0256  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5691  hypothetical protein  32.68 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0488  hypothetical protein  26.73 
 
 		 384 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.659139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0419  hypothetical protein  29.58 
 
 		 294 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0349  hypothetical protein  27.86 
 
 		 294 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1659  hypothetical protein  39.71 
 
 		 504 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8331  hypothetical protein  25.18 
 
 		 386 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1303  hypothetical protein  36.36 
 
 		 548 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.480323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  22.42 
 
 		 428 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>