20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3346 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0472  hypothetical protein  98.33 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.088779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3796  hypothetical protein  98.33 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3852  hypothetical protein  98.33 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3978  hypothetical protein  97.5 
 
 		 121 aa  243  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0514  hypothetical protein  96.67 
 
 		 135 aa  241  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0513  hypothetical protein  96.67 
 
 		 121 aa  239  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3518  hypothetical protein  96.67 
 
 		 121 aa  239  9e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0513  hypothetical protein  96.67 
 
 		 121 aa  239  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.819192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3283  hypothetical protein  88.33 
 
 		 121 aa  223  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3591  hypothetical protein  86.55 
 
 		 121 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3192  hypothetical protein  83.19 
 
 		 123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0536  hypothetical protein  69.42 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0213878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4086  hypothetical protein  73.28 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0551  hypothetical protein  71.19 
 
 		 121 aa  180  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3361  hypothetical protein  68.64 
 
 		 127 aa  173  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  26.13 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  23.64 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  21.67 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  22.88 
 
 		 124 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>