20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3231 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3231  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3697  hypothetical protein  77.62 
 
 
208 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.176724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3639  hypothetical protein  77.14 
 
 
208 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.313555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3821  hypothetical protein  77.14 
 
 
208 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0748  hypothetical protein  76.88 
 
 
225 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0808  hypothetical protein  80.9 
 
 
179 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3351  hypothetical protein  74.51 
 
 
230 aa  290  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0602  hypothetical protein  74.02 
 
 
230 aa  290  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3521  hypothetical protein  73.37 
 
 
197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0992  hypothetical protein  73.72 
 
 
196 aa  245  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0857  hypothetical protein  75 
 
 
199 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0942  hypothetical protein  72.85 
 
 
194 aa  237  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971072  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0662  hypothetical protein  55.61 
 
 
202 aa  218  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117194  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0634  hypothetical protein  64.07 
 
 
205 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2897  hypothetical protein  62.13 
 
 
208 aa  214  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1301  hypothetical protein  45.64 
 
 
205 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2013  hypothetical protein  39.56 
 
 
194 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1568  hypothetical protein  38.92 
 
 
193 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00113128  hitchhiker  0.0000220315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0724  hypothetical protein  38.64 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000310173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1740  hypothetical protein  32.93 
 
 
379 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>